Nghĩa trang quốc gia Culpeper được thành lập vào tháng 4 1867, tại một quận có thể đã chứng kiến nhiều cuộc chiến tranh Nội chiến hơn bất kỳ quận nào khác ở Virginia. Một số tượng đài tưởng niệm thương vong của Liên bang trong trận Cedar Mountain, diễn ra vào tháng 8 9, 1862. Được mỗi đội quân chiếm đóng trong nhiều tháng liền, Quận Culpeper là nơi diễn ra trận Brandy Station vào 9 tháng 6, 1863 trận chiến kỵ binh lớn nhất của cuộc chiến. Đây cũng là nơi đóng quân mùa đông của Quân đội Liên bang vào khoảng 1863-64, khi Trung tướng Ulysses S. Grant đến để nắm quyền chỉ huy. Những người lính Liên minh tử trận vì những hành động đó cũng nằm trong nghĩa trang. Nhà nghỉ của giám đốc theo phong cách Đế chế thứ hai được xây dựng vào 1872 theo thiết kế của Tổng cục trưởng Montgomery C. Meigs. Vào năm 1978 Hội Cựu chiến binh Chiến tranh Nước ngoài đã hiến tặng một vùng đất liền kề giúp tăng gấp đôi diện tích nghĩa trang và giảm bớt áp lực cho Nghĩa trang Quốc gia Arlington.  Nghĩa trang quốc gia Culpeper được liệt kê trong sổ đăng ký theo đề cử Tài liệu tài sản đa dạng (MPD) của Nghĩa trang quốc gia thời Nội chiến và đóng góp vào Khu lịch sử phố Đông Nam của thị trấn Culpeper.